距离假面骑士圣刃的变身者神山飞羽真等一众剑士们拼命拯救世界已经过去8年的时光。飞羽真收养了因卷入大战而失去父母的少年小陆。他的好友间宫和编辑须藤芽依也一起帮忙照顾。飞羽真想弥补小陆失去的父爱，但是却无法治愈他的创伤，已经11岁的他仍然没有露出笑容。另一方面成为翻译家的富加宫贤人即将与立花结菜结婚，正

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在禁断之地“阿卡斯提亚基地”中，封印着能够动摇世界的“危险的书籍”。某日，这些书籍被不知名的家伙解开了封印，散落四处。为了阻止这场危机，“炎之剑士”神山飞羽真和"全开凯撒"五色田介人被引领到了彼此的世界中。面对散落的危险书籍和背后的神秘力量，飞羽真和介人必须携手合作，穿越不同的时